女性生殖器先天性畸形的病因尚不清楚，但可能與染色體異常、內分泌失調、理化因素等有關，不能用一般治療、藥物治療或手術治療來治療。

1. 原因

1.染色體異常

胎兒性染色體發育異常會導致女嬰出生后生殖器官先天性畸形。

2、內分泌功能失調

腦下垂體、下丘腦、卵巢等重要器官出現故障也會影響體內性激素的分泌。生長發育過程中體內缺乏性激素刺激也會導致女性生殖器官先天畸形。

3、理化因素

女性如果在懷孕期間頻繁接觸放射性物質或化學物質或接受放射線檢查，可誘發女性生殖器官先天性畸形。

2. 治療

1. 一般治療

如果女性患有先天性女性生殖器官畸形，不影響經痛或生殖功能，或者患者年齡相對較小，可以初步觀察，定期復查。

2.藥物治療

如果罪魁禍首是子宮未成熟，可以在醫生的指導下用雌激素、黃體酮藥物進行周期療法，以維持女性正常的月經。

3.手術治療

如果女性未成熟的子宮引起腹痛或血腫，可以通過手術切除子宮（挑）。患有先天性陰道閉鎖的女性可以接受堡保留子宮的陰道手術、宮頸成形術和穿透手術。