中共福建省委黨校成立于1950年6月，福建行政學院成立于1995年11月。2011年11月，福建省委、省政府決定，省委黨校和福建行政學院實行“一套班子、兩塊牌子”聯合辦學體制。　　2021年6月，校院搬入位于閩侯上街的新校區。新校區占地面積660畝（建成部分占地540畝），建筑面積約24.5萬平方米，總投資近25億元，有辦公樓、教學樓、圖書館、文體館、學員公寓、專家樓、餐廳等33棟單體建筑，可同時容納1000多人在校培訓。校院現有內設機構29個，其中，行政管理機構15個、教研機構12個、教輔機構2個。現有專任教師142人，其中，正高級職稱34人、副高級職稱75人，博士生、碩士生導師18人；擁有享受國務院政府特殊津貼人員5人，以及一批省哲學社會科學領軍人才、省宣傳系統“四個一批”、省文化名家、百千萬人才工程省級人選等各類人才。古田干部學院于2021年3月被確定為校院古田分校（院）。習近平總書記十分關心和重視中共福建省委黨校、福建行政學院事業發展，在福建工作期間和到中央工作后，先后18次到省委黨校、福建行政學院調研、作報告。2010年9月4日，時任中共中央政治局常委、中央書記處書記、國家副主席、中央黨校校長的習近平同志專程蒞校視察，親切勉勵“要把黨校這個陣地建設好”。在省委的高度重視下，校院獲評第六屆全國文明單位；被確定為福建省習近平新時代中國特色社會主義思想研究中心重要成員單位和首批研究基地；在中央黨校（國家行政學院）對全國省級黨委黨校辦學質量評估中名列前茅，連續五屆被評為教學管理優秀獎；連續五屆榮獲全國黨校（行政學院）科研和決策咨詢工作先進單位獎。